Một mùa hè đáng yêu nữa lại đến với Illyasviel von Einzbern. Nghỉ ngơi sau nhiệm vụ cô gái phép thuật của mình, cô tận hưởng thời gian nghỉ ngơi sau khi thu thập Thẻ bài cùng với người bạn thân nhất Miyu Edelfelt.
Tuy nhiên, giờ nghỉ của cô đã kết thúc đột ngột khi cô và Miyu bị Rin Toosaka và Luviagelita Edelfelt bắt cóc, trong khi đi chơi với bạn bè. Các cô gái phép thuật biết rằng công việc của họ còn lâu mới kết thúc, vì Tháp Đồng hồ thông báo cho họ rằng mana ngoài tầm kiểm soát được cho là đã bị phong ấn tiếp tục phân tán khắp Thành phố Fuyuki. Sau khi đi đến điểm gốc của mana ngoài tầm kiểm soát, Illya và Miyu được giao nhiệm vụ giải quyết sự bất thường.
Nhưng sau khi sử dụng câu thần chú của họ, Illyasviel phát hiện ra rằng cô ấy đã chia thành hai người! Khi hình thức mới bí ẩn này phóng ra, cô chỉ có thể tự hỏi: điều gì đến từ sự tồn tại của dopplegänger của cô, chạy điên cuồng trong thị trấn không nghi ngờ?
