Câu chuyện xãy ra vào năm 2055. Chiến trường lần này là thế giới mô phỏng Trái đất được gọi là Second World. Những trận đấu trong phần này được gọi với cái War Time.
Một nhóm các cầu thủ trẻ có những kỹ năng tuyệt vời, chiến đấu chống lại những kẻ thù mạnh mẽ thông qua trận bóng siêu thời không, Inazuma Go! Và... Một nhóm người trẻ điều khiển ...
Một năm sau cuộc chiến với Người đổi mới, một tổ chức khủng bố mới có tên là Người phát hiện đe dọa thế giới bằng cách sử dụng LBX. Ban tham gia với những người bạn mới và cũ để ngăn chặn ...
